Acrobat9のファイルオプションの変更

いままでAcrobat8をシステムに含めて出荷しておりました。
Acrobat8ではPDF設定のファイルオプションり「互換性のある形式」のデフォルトがAcrobat5.0(PDF1.4)となっており、Acrobat9ではAcrobat6.0(P DF1.5)となっていました。
確かに出力されるPDFの形式が異なっていることは確認できましたが、このデフォルトの変更については理由があるのでしょうか。
またどのようなポイントに気をつけながら、この互換性のある形式を設定すればよいでしょうか。
システムでは、Acrobatの生成、PDFファイルの結合を行っています。